Έχουν τα γονίδια μελωδία; Πείραμα με την HbA…

Αν διαβάσατε το (όχι και τόσο σύντομο) βιογραφικό μου, είχα κάνει ένα αστείο σχετικά με την αλληλουχία της περιοριστικής ενδονουκλεάσης EcoRI. Αυτό μου έδωσε την ιδέα αν τα γονίδια έχουν μελωδία και δε μπορούσα να συνεχίσω με τη μέρα μου χωρίς να το διερευνήσω.

Πήγα λοιπόν στην πλατφόρμα του NCBI1 και έψαξα το γονίδιο της α αλυσίδας της αιμοσφαιρίνης του ανθρώπου (σύμφωνα με το NCBI: HBA1 hemoglobin subunit alpha 1 [ Homo sapiens (human)] Gene ID: 3039, updated on 3-Nov-20242). Στη συνέχεια, έκανα την εξής αντιστοίχηση:

  • Α (αδενίνη) -> Λα
  • Τ (θυμίνη) -> Σι
  • G (γουανίνη) -> Σολ
  • C (κυτοσίνη) -> Ντο

Πληκτρολόγησα, λοιπόν (ναι, μόνος μου, θα γκρινιάξω αργότερα) την αλληλουχία3/μελωδία στο πρόγραμμα που χρησιμοποιώ για να γράφω παρτιτούρες, με το εξής αποτέλεσμα:

Επέλεξα ως τέμπο τα 100 bpm, αρχικά είχα βάλει 80 που είναι ο μέσος καρδιακός παλμός, αλλά θα έβγαινε μεγαλύτερο το βίντεο και δεν ήξερα αν θα ήταν πολύ μεγάλο για να ανεβεί.

Δεν έχω πειράξει κάτι στην αλληλουχία, ούτε κοίταξα για εσώνια/εξώνια, ούτε για κωδικόνια κτλπ. Πήρα ακριβώς την αλληλουχία που έδωσε το GenSeq και την έγραψα στο πρόγραμμα.

Με βάση το εξής πείραμα, έβγαλα τα εξής αποτελέσματα:

  1. Τα γονίδια πράγματι, με λίγη φαντασία, έχουν μία όμορφη μελωδία.
  2. Είναι κάπως συγκινητικό να ακούς αυτό και να σκέφτεσαι ότι μέσα σου εκφράζεται η συγκεκριμένη μελωδία. Όχι μόνο αυτό, είναι απαραίτητη για να ζεις.
  3. Αν επιχειρήσω να το ξανακάνω, θα πάρω μερικές πρωτοβουλίες για να το κάνω να ακούγεται πιο μελωδικό. Από πάνω το αριστερό χέρι είναι ακριβώς το ίδιο με το δεξί. Αρχικά είχα σκεφτεί να παίζει την αντιπαράλληλη αλληλουχία, αλλά η “Λα” με τη “Σι” σχηματίζουν διάφωνο διάστημα, και θα ακουγόταν περίεργο στο αυτί.
  4. Αν επιχειρήσω να το ξανακάνω, θα γράψω πρώτα ένα προγραμματάκι στη C ή στην Perl να μου διαβάζει κατευθείαν την αλληλουχία, διότι τελικά ΙΣΩΣ ήταν κακή ιδέα να πρέπει να γράψω 800+ χαρακτήρες συνεχόμενους με το χέρι…

Αυτά για την ώρα. Οι αναφορές μου είναι παρακάτω. Αν το βρήκε έστω κι ένας ενδιαφέρον, ας μου στείλει ένα μήνυμα με ανατροφοδότηση/ιδέες. Το feedback είναι πάντα καλοδεχούμενο.

Until next time.

References:

  1. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
  2. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/3039
  3. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NG_000006.1?from=37543&to=38385&report=genbank

11 thoughts on “Έχουν τα γονίδια μελωδία; Πείραμα με την HbA…

Αφήστε μια απάντηση